1、机械性刺激和损伤
机械性刺激及造成组织损伤是寄生虫病共有的一种特征。如鲺寄生，以其口器及背甲腹面的倒刺刺伤、撕裂宿主皮肤，使宿主十分不安，病鱼出现狂游并跳离水面。大中华鳋的寄生可造成鳃组织的炎性水肿和细胞增生，外观上出现鳃丝末端肿大发白。机械性刺激、损伤可直接造成死亡亦可。
2、压挤与阻塞
一些寄生于鱼类体内的寄生虫往往能造成对宿主组织器官的压挤，引起萎缩、坏死和生理机能丧失。这种病变在实质性器官更为常见。
如鱼怪的寄生影响宿主生殖腺的发育，导致病鱼不育;舌状绦虫除影响性腺发育外，还可使病鱼体腔鼓起凸出，影响游泳，甚至腹部胀破，导致死亡。侧殖吸虫的大量寄生，可使小鱼的肠道阻塞而致死亡。
堵塞还可发生于血管中，如血居吸虫病就是典型的病例，三角形的虫卵堵塞肾血管、鳃血管，引起水肿与鳃丝坏死。
3、压掠夺宿主的营养
寄生虫的营养取自宿主，其结果必然是或多或少地对宿主产生某种危害，轻者表现为营养不良，生长发育受影响，重者可至死亡。
如锥体虫，鲟鱼鳃上的尼氏吸虫，每个虫体每天从鳃上吸取O.5毫升血液，每尾鲟鱼严重时可寄生300-400个虫体，这样宿主每天失血可多至150-200毫升，因之病鱼会很快消瘦。
4、毒素的作用
寄生虫在寄生过程中，其代谢产物排泄于宿主体内。有些寄生虫还能分泌特有的有毒物质，对宿主产生一定的影响。如鲺口刺基部的腺细胞能分泌毒素;大中华鳋摄食时能分泌酶行肠外消化等。
【预防措施】
病原、免疫力、环境，三方要素构成发病的基本原因，因而从这三方面下手，可尽可能准确的“全面预防”寄生虫。
1、鱼类越冬期间，体质消耗较大，因此，要注意加强鱼类的营养，选用较好的配合饲料投喂，定期在饲料中添加免疫调节产品，例如“黄芪多糖颗粒”、“虫虫草”、“纤灭”等纯中草药产品，可使鱼类的体质提高，对外界寄生虫等病原生物的抵抗力增强，有效防止寄生虫病的暴发。
2、杀灭鱼体携带的寄生虫。由于鱼体在越冬前或多或少都带有一定的寄生虫，水温一旦升高，这些寄生虫很容易大量繁殖，使鱼体大量感染。可以选用市场上一些安全、高效、无公害的消毒药物，例如“360云消”、“菌毒速消”等，较彻底地杀灭越冬鱼体本身携带的少量寄生虫。
3、工具专用。养鱼用的工具，往往成为传播鱼病的媒介，在条件许可的情况下，最好做到工具专塘专用。如果有困难，则要把使用过的工具经过消毒处理后再使用。
鱼体的黏液层、鳞片、皮肤、黏膜和各器官的分泌物等都有预防病菌、寄生虫侵袭的作用，当鱼体受到损伤时，病原生物就有机可乘，很容易进入鱼体并大量繁生，从而暴发鱼病，如赤皮病、水霉病等通常就是在鱼受到损伤的情况下感染的，避免鱼体受伤是预防鱼病工作的重要一环。
越冬期间，由于池塘较少换水，各类水生生物的代谢废物蓄积在水中，会产生大量的有毒产物，使鱼类的抵抗力大大下降，感染包括寄生虫在内的各类疾病的几率增加，因而调水、改底工作应继续。
